仓皇入缅
选择逃亡缅甸，永历帝的权臣马吉翔起了严重作用。马吉翔靠偷奸取巧、拍马逢迎博得了李定国欢心。昆明陷落前，朝臣大多主张迁往四川，永历帝也赞同这一主张，但马吉翔以为一旦入川，李定国将被袁宗第、郝永忠等大顺军将领分权，故而联合李定国心腹劝说李定国西撤，致使永历帝不得不向中缅边境撤离。马吉翔以为只需进入缅甸国境就可以保住身家性命，不惜趁夜鼓动士兵判乱，逼永历帝入缅。在马吉翔鼓动下，当晚，在夜色笼罩之下乱兵大肆掳掠，永历帝受此惊吓，急忙渡过曩本河，到达缅关。守关士兵得知有近两千人马随永历帝避难缅甸，便要求放下兵器后才允许入关，永历帝同意，就这样随便地被缅人解除了武装。
永历帝及其随从历尽艰苦抵达缅甸都城阿瓦后，便立刻派人前往缅都与缅王接洽。但是缅王拒绝接见逃亡朝廷的使者，只派汉人从中传达信息。后来，为了便于监视永历帝及其随从，缅王令人在阿瓦城隔河对岸用竹子围造了一座城，让永历君臣居住。
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咒水之难
暂时有了安身之地，永历君臣开始了寄人篱下的生活。习惯了纸醉金迷的南明朝臣不几日便故态复萌，不图进取，苟且偷安。
顺治18年(1661)5月23日，缅王的弟弟莽白发起宫廷政变，处死缅王自立。新王派使者向永历帝讨取贺礼，此时的永历帝已拿不出像样的东西，遂以其事不正为由不送贺礼，因此激怒了莽白。莽白决定铲除永历随行官员，派人通知永历朝臣过江议事。鉴于双方关系紧张，南明文武官员心怀疑惧都不敢前往。缅王又遣人来说，此去只是缅王邀请群臣饮咒水盟誓，以加强双方的信任，否则关系断绝。在缅方坚持下，次日，马吉翔及其他大小官员参加饮咒水盟誓。文武官员一到达盟誓地点就遭到缅兵攻击，被骗来饮咒水的官员全部遇难。
缅军随即突入永历君臣住所，把永历帝、太后、皇后、太子等25人集中于一所小屋内。永历帝妃妾等百余人大都自缢而死。为防永历帝自尽，缅王又遣人前来抚慰，送来一些生活用品，幸存人员方得苟延残喘。
