沉船文物的出水，引发了许多神秘问题：为什么“黑石号”会在远离新加坡海峡和马六甲海峡的勿里洞岛附近沉没？按照通常海上丝绸之路航行路线，商船应当绕过新加坡，穿越马六甲海峡，但它却向东南方向行驶了600余公里。它是迷失了方向，还是被风浪吹得偏离了航线，或者是要去爪哇海的某个港口？
船上发现的精致金银器皿在中国国内考古中也十分罕见，有的甚至还成双成对。它们究竟是中国人送出的礼品，还是要运到阿拉伯国家的市场上去出售？为何船上的钱币不多？船上的商人以什么方式在中国进行结算？这艘船在哪里装上了最后一批货物？商船究竟想驶往何处？……船上的文物吸引了全球多个领域研究者的兴趣，也引发了人们对历史上中国世界角色的丰富联想。
美国《国家地理》杂志（2009年第6期）文章中有这样一段描述：“中国2000多年前首次对世界展开贸易以后，就像蚌壳一样，时开时合。在唐代，蚌壳大开，且维持了数个世纪之久。一连串的发明让中国走上了世界经济强国之路。”
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