宇文化及自称大丞相，总揽百揆;造反诸臣，各有封赏。安排妥当后，宇文化及来到后宫，见四十九岁的萧皇后仍美如盛年，秀色可餐，当夜就在寝宫中将其占有。次日，依萧皇后所请，借托奉皇后之命，立秦王杨浩为帝，并将杨广尸体草草收殓，埋于西院滂珠堂。
宇文化及一如杨广旧制，霸占六宫嫔妃，恣意纵欲月余。方始从众议，夺舟由水路西归。途中为李密瓦岗军所阻，不能西进，只得暂入东郡。后又被李密杀败，退至魏县。宇文化及终日鬼混，不思进取，遂鸩杀杨浩，自立为帝，建国号为许，将萧皇后封为淑妃。才过半年，又被唐淮安王李神通所破，宇文化及逃往聊城。不久，在中原一带起兵的夏王窦建德带兵杀来，宇文化及抵挡不住，城破被杀。夏王窦建德俘获了萧皇后与隋后宫嫔妃以及隋朝百宫，并获传国玉玺及卤薄仪仗。窦建德被萧皇后的美貌深深吸引，遂霸占萧皇后，将其纳为姬妾。随后，窦建德便尽情于声色，忘了逐鹿中原之大计。窦建德的原配妻子曹氏生性妒嫉剽悍，在夏王与萧氏沉浸于温顺乡中之时，常常不期而至，使之尴尬，但窦建德毫无办法。不久，只好把隋后宫嫔妃全部遣散，将萧皇后和皇族人员安置到武强县。
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此时，正值北方突厥强盛，隋文帝时远嫁突厥和亲的义成公主(杨广堂妹，大业三年杨广北巡榆林时遭到接见和赏赐，大业十一年杨广雁门被围时又设法解围)不忘旧情，得知萧皇后下落后，便派使者前来迎接萧皇后。窦建德不敢与突厥人正面对抗，只得将萧皇后交与来使。于是，萧皇后携孙杨政道及皇族一干人等北入突厥，开始了逃亡生涯。突厥处罗可汗见萧皇后貌美，纳其为王妃。封杨政道为隋王，并将萧皇后带去的人众以及前后归入突厥的隋人编成部落，居住在隋王封地定襄城(今内蒙和林格尔)。外罗可汗死后，按突厥人的风俗，已故番王的侍妾又被新番王颉利可汗接收。可怜萧氏从贵为天朝的皇后，两度沦为寄人篱下的番王侍妾，个中辛酸，又有谁知?
唐贞观三年(公元629年)，唐太宗命兵部尚书李靖为定襄道行军总管征讨突厥。贞观四年正月，李靖夜袭定襄，大破突厥，获萧皇后及孙杨政道归唐。据野史记述，回京后，李世民纳萧皇后为昭容。但此说无正史佐证，斯时萧皇后已是六十二岁的老妇了，而三十三岁的李世民又如何会纳老表婶为妾?可见野史此说不靠谱。不过，唐太宗对饱经风霜的萧皇后仍十分礼遇，赐良宅，居京城，并授杨政道为员外散骑侍郎。唐贞观二十二年(648年)，过了十八年平静生活的萧皇后，以八十岁高龄逝于长安。唐太宗下诏，恢复其皇后号，谥号曰：愍皇后，以皇后之礼出殡，与隋炀帝合葬于江都。几经飘零的萧皇后，最终仍归于桃花劫的起点上了。如此算来，萧皇后应是中国历史上经历桃花劫最多的皇后。也不知萧皇后几经桃花劫难的命运，能否在冥冥中，是在为隋炀帝荒淫残暴的罪行买单?!
