皇太极和哲哲的这门亲事是由努尔哈赤决定的。起初,科尔沁蒙古与后金的关系并不太好。明万历二十一年(1593年),科尔沁部首领明安曾和叶赫、辉发等九部组成联军,向努尔哈赤发动大规模进攻,结果被努尔哈赤运用机动灵活的战术击败。次年(1594年)。明安主动与努尔哈赤建立了友好关系。从此,双方的联系一直不断,关系越来越好。努尔哈赤和皇太极都把自己的女儿嫁给科尔沁蒙古王公当福晋,科尔沁蒙古王公也把自己的女儿送给努尔哈赤和皇太极作后妃。通过双方的联姻,进一步巩固了满蒙联盟。明万历四十二年(1614年)四月,哲哲离开娘家后,努尔哈赤命皇太极亲自迎到辉发扈尔奇山城,在此大宴亲朋,与哲哲举行了婚礼。
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天命十一年(1626年)八月,努尔哈赤死了,经过激烈争夺,皇太极于当年九月继承了汗位。哲哲被封为中宫大福晋,此后,哲哲的母亲科尔沁大妃便常来盛京看望女儿。每次这位大妃来盛京,皇太极都要亲自迎接,并赏赐给许多金银珠宝、绫罗绸缎。
崇德元年(1636年),皇太极在登基之后,对其后宫进行册封。盛京(今辽宁沈阳)的后宫,包括清宁宫、关雎宫、永福宫、麟趾官和衍庆宫,是后妃居住之处。皇太极有后妃15人,其中7人来自蒙古,这7人中又有3人来自蒙古科尔沁部,她们都姓博尔济吉特氏,而且是姑侄两辈。原来的中宫大福晋哲哲现在被封为清宁宫中宫皇后;哲哲的大侄女海兰珠是莽古思之子贝勒寨桑之女,现在被封为宸妃,居于关雎官;小侄女布木布泰是海兰珠的妹妹,现在被封为庄妃,居于永福宫;其他两宫来自蒙古阿霸垓部,一个是塔布囊博第塞楚祜尔之女巴特玛·璨,被封为衍庆宫淑妃,另一个是阿霸垓郡王额齐格诺颜之女娜木钟,被封为麟趾宫贵妃。